Caracterización genómica de dos líneas genéticas de bovinos Shorthorn seleccionados para producción pastoril o intensiva

Abstract

La Shorthorn es la primera raza bovina que llegó a nuestro país desde Escocia en 1823. Hoy en día se encuentra fundamentalmente distribuida en la pampa húmeda donde produce bajo sistemas pastoriles desde hace años. En Argentina la raza ha estado trabajando en un programa de selección basado en producción pastoril, pero sin incluir información genómica aún. Por el contrario, en países como Estados Unidos y Canadá la raza ha sido seleccionada para producción intensiva, utilizando marcadores genómicos. El presente estudio pretende determinar la huella de selección genómica de la población local de la Raza Shorthorn, seleccionada durante 30 años por genética pastoril, y compararla con la existente en animales extranjeros seleccionados para producción intensiva. Para ello se analizaron 19 animales (11 provenientes de Argentina (nativos) y 8 de Estados Unidos y Canadá (extranjeros), los cuales fueron analizados mediante mediciones fenotípicas y genotipado masivo utilizando microarrays de SNP de mediana densidad. Los datos fenotípicos fueron comparados entre grupos mediante pruebas estadísticas. Los datos genómicos fueron analizados utilizando diversas aproximaciones, como análisis de diversidad genética mediante test de componentes principales (PCA), grado de composición genética entre grupos, mediante test de admixture y consanguinidad molecular a nivel cromosómico por el método de runs of homozygosity (FROH). Finalmente, se determinó la prevalencia de alelos desfavorables de enfermedades de origen genético, así como de parámetros relacionados a la calidad de la carne. Este estudio preliminar es la primera aproximación genómica al estudio de la Raza Shorthorn en la Argentina.